由于活塞與泵缸間填襯不嚴，吸入閥和排出閥啟閉不及時等原因，雙吸泵的實際流量比理論流量小，而且隨壓頭的升高，還會出現漏液現象，實際流量還會有所降低，雙吸泵的流量不能用調節出口閥的方法調節，因不論此閥門開大或關小，活塞都要將工作室的液體排出去。如果出口閥關閉，泵內壓力將急劇升高，若系繼續運轉，系體或傳動機構就要受損，所以，雙吸泵啟動前必須將出口管上的閥門開啟，這是與離心泵不同的。
 

雙吸泵的流量調節，理論上可通過改變活塞或活校的截面積，沖程長度及其單位時間內的轉速次數來實現，但這要改變泵的結構，實際中難以實現。所以一般都用安裝回流支路的方法來調節流量，即使部分液體回流進入吸入管。這種調節方法簡單易行，但會造成能量損失，使泵的效串較低。